Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLN5O75503 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN5O75503 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN5O75503 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN5O75503 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN5O75503 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN5O75503 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLN5O75503 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN5O75503 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN5O75503 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms