Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms