Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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MTSS1O43312 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTSS1O43312 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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