Protein–RNA interactions for Protein: O15444

CCL25, C-C motif chemokine 25, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25O15444 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL25O15444 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL25O15444 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCL25O15444 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms