Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms