Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F3O00716 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F3O00716 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E2F3O00716 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms