Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGRPO00253 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGRPO00253 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AGRPO00253 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms