Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms