Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf49A4QMS7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms