Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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