Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms