Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SBNO2Q9Y2G9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms