Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO3Q9UK99 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO3Q9UK99 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms