Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP21Q9UK80 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP21Q9UK80 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms