Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DBF4Q9UBU7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms