Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SUCLA2Q9P2R7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUCLA2Q9P2R7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms