Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF19AQ9NV58 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms