Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUOX2Q9NRD8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DUOX2Q9NRD8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms