Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MID1IP1Q9NPA3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MID1IP1Q9NPA3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms