Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDGFDQ9GZP0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFDQ9GZP0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms