Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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