Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP4Q9C0A0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms