Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms