Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRNKL1Q9BZJ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRNKL1Q9BZJ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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