Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms