Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFT27Q9BW83 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFT27Q9BW83 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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