Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIRIP3Q9BW71 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms