Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms