Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms