Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms