Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms