Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF4Q96M43 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF4Q96M43 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms