Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TM4SF18Q96CE8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms