Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UTP4Q969X6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms