Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP4Q8N2S1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms