Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE4Q8N205 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms