Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms