Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms