Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q71RC1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q71RC1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q71RC1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q71RC1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms