Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM179Q6ZVK1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms