Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms