Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms