Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD40Q6AI12 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms