Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAD1Q5T700 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms