Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC178Q5BJE1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms