Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms