Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NBPF1Q3BBV0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms