Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A8Q2Y0W8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A8Q2Y0W8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms