Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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