Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCBQ16585 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCBQ16585 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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